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高校实验室建设的安全问题主要以建设绿色环保的环境友好型实验室为重点。在化学实验中用到的药品种类繁多，危险性也较大，在实验过程中产生废气、废液和固体残渣等废弃物质，这些废弃物对环境都有不同程度的危害，因此，针对不同的废弃物类型要选择不同的处理措施。
一、高校实验室之废气的处理
在化学实验室建设过程中，通常采用以下几点措施来保证化学药品或化学反应产生的刺鼻气味即是排出实验室。
（1）根据实验室规模的大小，每个实验室有1~2个通风柜，气味较大或难闻的实验可在通风柜内进行操作，以便将气体及时排出，最大程度上减少气味的扩散，将危害降到最低。
（2）实验室内设有排风系统，每个实验室的天花板位置都装有多个排风口，实验课时开启排风功能。
（3）有机和无机实验室与其他实验课相比，用到药品更加复杂、种类多且气味重，除了上述排气方式外，此类实验室的实验台上方装有全覆盖式排气罩，可有效且及时的排出实验室中产生的气味。
从实验室排出的气体，如氨气、硫化氢等，不仅气味刺鼻，危害人们的身体健康，而且直接排放到空气中还会引起酸雨等环境问题，因此，在实验室建设时也建造了废气处理设备。在实验楼顶部平台安装多台废气净化处理装置，废气先通过装有无机或有机原料的反应釜，通过干式吸附的方式吸收大部分气体，再经过小型自来水喷淋装置，进一步吸收废气中的可溶性气体。通过以上两步净化过程，残余气体基本的达到排放标准。
二、高校实验室之废液的处理
实验室产生的废液按照成分和毒性大小分类，大致可分为实验废弃液体药品和洗瓶废液两大类，可分别采取以下两种不同类型的处理方式：
（1）实验室废弃液体药品如有机废液等，此类废液往往是多种药品的混合，具有浓度大、气味大、颜色深、危害性大的特点，此类废液实验室还不具备处理能力，需回收在特定的废液桶中，按照《国家危险废物名录》要求张贴标签，置于危险品仓库中暂存，然后处理。
（2）实验室清洗玻璃瓶等产生的废液中残存少量药品，如酸、碱等，直接排放不仅会腐蚀下水管道，还会污染水源。因此在实验室建设时，下水管道全部采用耐腐蚀的聚丙烯(PP)材料，而且室外还建有一个10m3左右的污水处理池，对洗瓶废液进行中和或简单处理后再排走。
三、高校实验室之固体废弃物的处理
实验产生的固体废弃物包括空药品瓶、药品残渣、残留或失效的化学试剂等，此类废弃物亦无处理能力，只能分类回收储存，定期委托有资质的公司处理。分类收集方式包括以下几点：
（1）实验课用到药品种类和数量繁多，会产生大量空玻璃瓶或塑料药品瓶，将玻璃瓶和塑料瓶分别装于纸箱中密封保存，张贴分类标签。
（2）药品废渣设有专门垃圾桶回收，张贴分类标签后暂存。
（3）残留或失效的化学试剂仍置于原试剂瓶中，再装于纸箱中密封保存，等待一起处理。
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