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微生物实验室建设要不同于一般的实验室工程或净化工程。主要应用于微生物学、生物医学、生物化学、动物实验、基因工程以及生物制品研究使用的实验室统称为生物安全实验室,一般由主体实验室和辅助功能实验室组成。微生物安全实验室必须保证人身安全、环境安全、废弃物安全和样本安全，能长期而安全的运行，同时还为需要实验室工作人员提供一个舒适，而良好的工作环境。
一、意义及目的微生物学是研究微生物及其生命活动的科学。微生物具有种类繁多、体积微小、代谢类型多、代谢强度高、生长繁殖速度快、容易变异等多种特点。它广泛分布于空气、水、土壤、人体及动植物体,营独立或寄生生活。大多数微生物对人类和动植物是有益的,特别是它与人类的生活有密切的关系，对工农业生产、人类的生活环境和健康卫生有极大的影响。
随着新课程改革，中学微生物在中学教学中的篇幅也有所增加，微生物学实验不仅综合性和操作性强,而且要求学生具备较强的无菌操作技能和生物安全意识。对培养学生理论联系实际、动手能力、分析解决问题能力、科学思维等有重要意义。
二、功能与要求微生物实验室的主要设备有:发酵罐、高压灭菌锅、超净工作台、电热恒温培养箱、恒温恒湿培养箱、电热鼓风干燥箱、移液器、奥林巴斯显微镜、冰箱、全温振荡器、远红外快速干燥箱等现代化高科技实验设备。实验室可以进行微生物的培养，微生物代谢产物的生产与分离，食品及饮用水微生物指标检测，微生物的筛选等实验。能够较好的完成教材教学实验的需要，同时现代化的仪器配置可以满足学生的兴趣探究活动。
微生物实验室由准备室、洗涤室、灭菌室、无菌室、恒温培养室和普通实验室六部分组成。这些房间的共同特点是地板和墙壁的质地光滑坚硬，仪器和设备的陈设简洁，便于打扫卫生。
三、微生物实验室基本要求微生物实验室准备室用于配制培养基和样品处理等。室内设有试剂柜、存放器具或材料的专柜、实验台、电炉、冰箱和上下水道、电源等。
洗涤室用于洗刷器皿等。由于使用过的器皿已被微生物污染，有时还会存在病原微生物。因此，在条件允许的情况下应设置洗涤室。室内应备有加热器、蒸锅,洗刷器皿用的盆、桶等，还应有各种瓶刷、去污粉、肥皂、洗衣粉等。
四、灭菌室灭菌室主要用于培养基的灭菌和各种器具的灭菌，室内应备有高压蒸汽灭菌器、烘箱等灭菌设备及设施。
洁净室五、无菌室无菌室也称接种室,是系统接种、纯化菌种等无菌操作的专用实验室。在微生物中，菌种的接种移植是一项主要操作,这项操作的特点就是要保证菌种纯种，防止杂菌的污染。在一般环境的空气中，由于存在许多尘埃和杂菌，很易造成污染，对接种工作干扰很大。
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